药用微生物资源是指在微生物药物与生物技术药物的研究与开发领域中具有实际或潜在应用价值和科学意义的微生物菌种资源及其相关信息资源，是一类与人类健康、社会经济发展关系密切的极其重要的微生物资源。主要包括已知药物产生菌、候选药物产生菌、基因工程菌、新药筛选中获得的各类活性物质产生菌、各种模式菌、基因受体和供体菌、遗传物质及相关信息资源。

    药用微生物资源共享平台属于国家自然科技资源平台下的微生物资源共享平台。平台建设于2003年度在国家科技部的领导下启动，其目标是在《国家科技基础条件平台建设纲要》的指导下，根据“国家自然科技资源共享平台”的建设目标和总体规划，以药用微生物资源有效保护和高效共享为主线，密切结合医药科技创新，保障人民健康，发展制药产业的需求，建设一个管理规范、设施先进，运行高效的，拥有相当规模的药用微生物菌种资源库、信息数据库和网络系统的国家科技基础条件平台，为我国医药科技创新与持续发展提供重要科技基础支撑。

    国家药用微生物资源共享平台的依托单位是中国医学科学院医药生物技术研究所。2003 年度承担了国家科技基础条件平台工作重点项目“微生物菌种资源描述标准和规范的研究制定及共享试点建设”及“创建国家微生物菌种资源共享体系”，2004年度和2005年度承担了国家科技基础条件平台工作项目“药用微生物资源标准化整理、整合及共享试点”。目前平台参加单位有国内几个主要的微生物药物研发单位：华药集团新药研发中心，四川抗菌素工业研究所，福建省微生物研究所，上海来益生物药物研发中心。近二年来平台建设的主要任务是：制定并验证、完善若干重要的微生物资源描述规范和与微生物菌种资源搜集、保存管理相关的规范与技术规程：按照统一的规范初步整理、整合了四个单位菌库中的药用微生物菌株2000株菌，初步建立了《药用微生物菌种资源信息数据库》；完成了8000株微生物新药筛选菌株和相关信息的初步整理，整合，建立了《微生物新药筛选菌株数据库》；上传国家E平台2000多株菌的信息数据，通过《药用微生物菌种保藏管理网》和国家自然科技资源E平台初步实现药用微生物信息资源的社会共享；不断开展稀有微生物与特殊环境微生物菌种的搜集、分离与保藏，持续地为国家微生物新药研究提供筛选菌株；完善微生物菌种鉴别系统，提高鉴别水平；稳定了一支微生物资源平台从业人员队伍；研究微生物资源共享机制，提高共享效率。